Учёные нашли в почве сотни неизвестных бактерий и два новых антибиотика

Учёные из Университета Рокфеллера представили инновационный метод, позволивший получить доступ к подавляющему большинству почвенных бактерий, ранее недоступных для исследований.

Технология заключается в выделении крупных фрагментов ДНК прямо из образцов почвы и последующей полной сборке геномов с помощью нанопорового секвенирования.

В результате анализа одного образца лесной почвы был собран рекордный массив данных — 2,5 терабаз пар последовательностей. Этот объём информации открыл доступ к сотням ранее неизвестных бактериальных видов, а их генные коды удалось превратить в реальные молекулы средствами синтетической биологии.

Открытие привело к созданию двух уникальных антибиотиков нового поколения. Первый — эрутацидин — действует на клеточные мембраны бактерий, вызывая их разрушение. Второй — тригинтамицин — блокирует белок ClpX, крайне редкую мишень для современной антимикробной терапии.

Разработанный метод универсален: его можно применять к любым метагеномным образцам, будь то океаническая среда, кишечная микробиота или экстремальные экосистемы. Ученые считают, что такой подход открывает доступ к крупнейшему резервуару биоразнообразия на Земле и меняет парадигму поиска лекарств — от необходимости выращивания микроорганизмов в лаборатории к прямому чтению их генетического кода.

Это достижение обозначает новый этап в глобальной борьбе с устойчивостью бактерий к антибиотикам и обеспечивает системное изучение ранее скрытой «тёмной материи» микробного мира.